El objetivo N° 12 de la Fuerza Aérea plantea: “Preservar el medio ambiente: uso racional, conservación y protección de los recursos naturales, así mismo el manejo integral de los residuos generados al interior de las Unidades, enmarcado en la normatividad ambiental vigente. En general crear una cultura de respeto y conservación del medio ambiente”.
Como muestra de su compromiso, la Fuerza Aérea incluyó en el Plan Estratégico Institucional (PEI) la política de protección del medio ambiente, esto se hizo a través de la certificación ISO 14001 con la cual se acreditaron todas las Bases Aéreas mediante un sistema de gestión ambiental.